Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UQCRFS1P1P0C7P4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCRFS1P1P0C7P4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms