Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms