Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB7P09629 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB7P09629 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms