Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms