Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEFMP07197 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEFMP07197 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEFMP07197 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms