Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HBE1P02100 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBE1P02100 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBE1P02100 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HBE1P02100 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HBE1P02100 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms