Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX6O95475 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX6O95475 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX6O95475 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX6O95475 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX6O95475 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX6O95475 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX6O95475 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX6O95475 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX6O95475 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms