Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UFL1O94874 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFL1O94874 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFL1O94874 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFL1O94874 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms