Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTL6BO94805 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms