Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms