Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP2O75323 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms