Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms