Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EXTL3O43909 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms