Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF14O43557 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms