Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SYNMO15061 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SYNMO15061 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNMO15061 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNMO15061 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNMO15061 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms