Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASKO14936 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASKO14936 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASKO14936 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms