Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOR1AO14656 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOR1AO14656 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms