Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC7O00311 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC7O00311 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC7O00311 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC7O00311 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms