Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIP1O00291 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIP1O00291 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIP1O00291 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIP1O00291 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms