Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCER2I3L3R5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCER2I3L3R5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms