Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L12C9JPN9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms