Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRDCB7Z8K6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms