Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXI3A8MTJ6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXI3A8MTJ6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms