Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDR42E2A6NKP2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDR42E2A6NKP2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDR42E2A6NKP2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDR42E2A6NKP2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDR42E2A6NKP2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms