Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
A4D1N5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
A4D1N5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
A4D1N5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
A4D1N5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms