Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms