Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms