Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms