Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-11Q9UQG0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms