Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF2Q9UNY4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms