Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms