Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF3Q9ULD4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms