Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP3Q9UKI2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42EP3Q9UKI2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms