Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNIKQ9UKE5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TNIKQ9UKE5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms