Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPN3Q9UHW5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms