Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP25Q9UHP3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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