Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DBF4Q9UBU7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms