Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms