Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABI3Q9P2A4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms