Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VNN3Q9NY84 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms