Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BSDC1Q9NW68 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms