Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00846Q9NV44 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00846Q9NV44 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms