Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms