Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP7BPQ9NSQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms