Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRN4Q9NRL3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms