Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms