Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms