Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INCENPQ9NQS7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INCENPQ9NQS7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms