Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms