Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms